Nachádza sa mimo zastavaného územia. Ústne podanie hovorí, že vtedajšia obec sa rozprestierala okolo kostola, ale v dobe tureckého obliehania obyvatelia opustili svoje sídla a presťahovali sa na teritórium terajšej obce, ktoré bolo v tých časoch močaristé, poprerastané hustými lužnými lesmi, ktoré poskytovali obyvateľstvu ochranu.
Po zániku tureckého nebezpečenstva sa ľudia už do pôvodných sídiel nevrátili. Takto sa vysvetľuje poloha kostolíka ležiaceho v otvorenom poli asi na 1000 metrov od obce. Ako spomienku na turecké časy má kostol na vežovom kríži zavesený konský chvost a kovový polmesiac.
Kostolík bol postavený na sklonku XII. a začiatkom XIII. storočia v románskom slohu. Vyznačuje sa masívnym murivom so silnými podopierajúcimi rebrami z vonkajšej strany, s polkruhovitou klenbou a s polkruhovitými oknami a portálom.
V análoch ostrihomskej kapituly z rokov 1332-1337 je zaznamenané, že v týchto rokoch bol malomačanský kostol farským kostolom dioseckým (Sládkovičovo).
Ďalší záznam je z roku 1561 a to zápisnica o kanonickej vizitácii dioseckej farnosti, ktorú nariadil vtedajší ostrihomský arcibiskup prímas Mikuláš Oláh.

Za úradovania ostrihomského arcibiskupa prímasa Petra Pázmánya bola na dióseckej fare ďalšia kanonická vizitácia a v zápisnici z nej sa uvádza: "V dávnych časoch mala pekný kostol ku cti sv. Margity vonku v poli, ale tento zanedbali a preto vzhľadom na jeho starobu začal sa rozpadávať“.
Malomačiansky kostol bol vysvätený k úcte spomenutej svätice, ktorej pamätný deň pripadá na 13. júla. Prvú nedeľu po tomto dni slávi obec Malá Mača pamiatku vysviacky kostola, takzvaný odpust, ľudové hody - od nepamäti až podnes.
Kostol bol viac krát opravovaný a rozšírený prístavbou. Pôvodne mal aj kryptu, ktorá bola otvorená pri oprave v roku 1903. V sutinách sa našli ľudské kosti, najmä lebky, gombíky z vojenského výstroja a zvyšky zbraní. Posledná oprava kostolíka bola realizovaná v roku 1948, kedy bola celá budova bola nanovo okovaná a fasáda natretá žltou farbou. Okná boli zväčšené, ale ponechané v pôvodnom slohu. Strieľňam sa podobajúce otvory na veži boli zamurované. Zákristia na severnej strane bola pripojená ku kostolu, čím sa rozšíril vnútorný priestor. Na východnej strane sanktuária bola postavená nová zákristia. Starý drevený chór bol odstránený a nahradený novým železo betónovým. Celý vnútorný priestor bol opatrený novou betónovou dlažbou. Tehlou murovaný múr okolo kostola opravený nebol.
Kostol je postupne obnovovaný vďaka Ministerstvu kultúry SR - grantový program Obnovme si svoj dom

ARCHEOLOGICKÉ LOKALITY
V katastri obce Malá Mača eviduje Archeologický ústav Slovenskej akadémie vied v Nitre (zistené predovšetkým zberom) - sídlisko z doby rímskej, neolitické pohrebisko, včasnostredoveké a stredoveké sídlisko.